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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6mq5B_ | 2.15 | PDB header: structural protein | Chain: B: PDB Molecule: clip-associating protein 1; |
Added to library: Sat Jul 20 08:20:31 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | X | E | P | R | X | E | S | C | L | A | Q | V | L | Q | K | D | V | G | K | R | L | Q | V | G | Q | E | L | I | D | Y | F | S | D | K | Q | K | S | A | D | L | E | H | D | Q | T | X | L | D | K | L | V | D | G | L | A | T | S | W | V | N | S | S | N | Y | K | V | V | L | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | X | D | I | L | S | A | L | V | T | R | L | Q | D | R | F | K | A | Q | I | G | T | V | L | P | S | L | I | D | R | L | G | D | A | K | D | S | V | R | E | Q | D | Q | T | L | L | L | K | I | X | D | Q | A | A | N | P | Q | Y | V | W | D | R | X | L | G | G | F | K | H | K | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | G | T | T | S | S | T | S | T | T | G | G | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | R | T | R | E | G | I | C | L | C | L | I | A | T | L | N | A | S | G | A | Q | T | L | T | L | S | K | I | V | P | H | I | C | N | L | L | G | D | P | N | S | Q | V | R | D | A | A | I | N | S | L | V | E | I | Y | R | H | V | G | E | R | V | R | A | D | L | S | K | K | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | P | Q | S | R | L | N | V | I | F | T | K | F | D | E | V | Q | K | S | G | N | X | I | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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