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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6ls9C_ | 2.50 | PDB header: viral protein | Chain: C: PDB Molecule: envelope glycoprotein d; |
Added to library: Sat Jun 20 08:22:07 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | P | R | V | T | V | Y | V | D | P | P | A | Y | P | M | P | R | Y | N | Y | T | E | R | W | H | T | T | G | P | I | P | S | P | F | A | E | Q | P | V | E | V | R | Y | A | T | S | A | A | A | C | D | M | L | A | L | I | A | D | P | Q | V | G | R | T | L | W | E | A | V | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | B | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | H | A | R | A | Y | N | A | T | V | I | W | Y | K | I | E | S | G | C | A | R | P | L | Y | Y | M | E | Y | T | E | C | E | P | R | K | H | F | G | Y | C | R | Y | R | T | P | P | F | W | D | S | F | L | A | G | F | A | Y | P | T | D | D | E | L | G | L | I | M | A | A | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | R | L | V | E | G | Q | Y | R | R | A | L | Y | I | D | G | T | V | A | Y | T | D | F | M | V | S | L | P | A | G | D | C | W | F | S | K | L | G | A | A | R | G | Y | T | F | G | A | C | F | P | A | R | D | Y | E | Q | K | K | V | L | R | L | T | Y | L | T | Q | Y | Y | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G | S | B | T | T | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | ||||||||||||||||||||
Sequence | Q | E | A | H | K | A | I | V | D | Y | W | F | M | R | H | G | G | V | V | P | P | Y | F | E | E | S | K | G | Y | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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