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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5jqcA_ | 2.15 | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: lmo1076 protein; |
Added to library: Sat May 21 08:45:11 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | L | Y | D | T | I | K | Q | Q | K | N | V | S | E | D | A | K | V | V | K | A | D | G | H | G | V | Y | S | G | I | Y | N | T | S | A | A | S | A | K | K | L | S | T | G | A | P | Y | N | N | K | D | V | K | I | L | K | E | G | T | T | S | R | G | T | W | V | Q | F | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | B | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | N | K | V | I | G | W | X | D | K | R | A | F | V | Y | Y | P | K | A | T | N | V | K | T | L | N | L | T | G | K | I | T | A | G | S | T | N | G | L | W | S | E | V | P | G | T | V | N | A | K | K | L | A | T | T | A | G | A | Y | Q | N | K | D | A | K | I | I | K | Q | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | G | G | G | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | I | S | G | R | T | Y | Y | Q | F | Q | V | G | G | K | T | I | G | W | L | D | A | R | A | F | H | V | Y | D | K | I | Q | S | Q | S | N | V | N | W | N | R | T | I | L | N | A | D | K | H | G | V | Y | S | G | V | Y | N | T | S | S | S | S | X | N | K | L | S | T | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | S | T | T | S | B | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||
Sequence | K | Y | N | N | K | K | V | K | V | I | K | Q | A | K | T | A | R | G | T | W | Y | Q | F | Q | V | N | G | K | T | V | G | W | X | D | Y | R | A | F | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | T | T | T | T | T | T | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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