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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5j7rB_ | 2.50 | PDB header: membrane protein | Chain: B: PDB Molecule: putative lipoprotein; |
Added to library: Sat Apr 23 08:17:16 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | I | A | N | D | L | I | G | D | I | D | L | S | L | Y | F | D | G | T | K | D | E | Q | N | P | K | I | E | Q | Q | E | I | L | V | D | G | D | E | I | L | G | Q | Y | L | I | Q | A | L | I | Q | G | P | S | Q | K | G | S | L | A | P | I | L | P | K | D | T | K | L | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | D | I | K | D | D | I | A | I | I | N | L | S | K | E | A | I | V | N | X | S | A | T | K | E | Q | A | T | L | E | G | I | I | A | T | I | T | Q | I | P | S | I | N | K | I | N | I | L | V | D | N | Q | X | V | D | S | L | G | G | N | F | D | I | S | K | P | F | G | K | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | S | T | T | S | T | T | B | S | S | S | S | S | B | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | I | P | N | L | K | I | N | N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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