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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5j39B_ | 1.95 | PDB header: transcription | Chain: B: PDB Molecule: tudor and kh domain-containing protein; |
Added to library: Sat Apr 16 08:18:47 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | R | E | N | L | Y | F | Q | G | E | V | Y | V | S | A | S | E | H | P | N | H | F | W | I | Q | I | V | G | S | R | S | L | Q | L | D | K | L | V | N | E | M | T | Q | H | Y | E | N | S | V | P | E | D | L | T | V | H | V | G | D | I | V | A | A | P | L | P | T | N | G | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | - | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | W | Y | R | A | R | V | L | G | T | L | E | N | G | N | L | D | L | Y | F | V | D | F | G | D | N | G | D | C | P | L | K | D | L | R | A | L | R | S | D | F | L | S | L | P | F | Q | A | I | E | C | S | L | A | R | I | A | P | S | G | D | Q | W | E | E | E | A | L | D | E | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | G | G | G | G | G | G | S | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | D | R | L | T | H | C | A | D | W | K | P | L | V | A | K | I | S | S | Y | V | Q | T | S | T | W | P | K | I | Y | L | Y | D | T | S | N | G | K | K | L | D | I | G | L | E | L | V | H | K | G | Y | A | I | E | L | P | E | ||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | - | S | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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