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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5igqC_ | 3.90 | PDB header: hydrolase/peptide | Chain: C: PDB Molecule: e3 ubiquitin-protein ligase rfwd2; |
Added to library: Sat Apr 23 09:02:52 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | F | Q | E | C | L | S | K | F | T | R | Y | N | S | V | R | P | L | A | T | L | S | Y | A | L | Y | N | G | S | S | I | V | S | S | I | E | F | D | R | D | C | D | Y | F | A | I | A | G | V | T | K | K | I | K | V | Y | E | Y | D | T | V | I | Q | D | A | I | H | Y | P | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | E | M | T | C | N | S | K | I | S | C | I | S | W | S | S | Y | H | K | N | L | L | A | S | S | D | Y | E | G | T | V | I | L | W | D | G | F | T | G | Q | R | S | K | V | Y | Q | E | H | E | K | R | C | W | S | V | D | F | N | L | M | D | P | K | L | L | A | S | G | S | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | A | K | V | K | L | W | S | T | N | L | D | N | S | V | A | S | I | E | A | K | A | N | V | C | C | V | K | F | S | P | S | S | R | Y | H | L | A | F | G | C | A | D | H | C | V | H | Y | Y | D | L | R | N | T | K | Q | P | I | M | V | F | K | G | H | R | K | A | V | S | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | B | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | K | F | V | S | G | E | E | I | V | S | A | S | T | D | S | Q | L | K | L | W | N | V | G | K | P | Y | C | L | R | S | F | K | G | H | I | N | E | K | N | F | V | G | L | A | S | N | G | D | Y | I | A | C | G | S | E | N | N | S | L | Y | L | Y | Y | K | G | L | S | K | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . |
Sequence | L | L | T | F | K | F | D | T | V | N | E | F | V | S | A | V | C | W | R | A | L | P | D | G | E | S | N | V | L | I | A | A | N | S | Q | G | T | I | K | V | L | E | L | V | ||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S |
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