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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5iesC_ | 2.16 | PDB header: immune system/ viral protein | Chain: C: PDB Molecule: germline-targeting hiv-1 gp120 engineered outer domain eod- |
Added to library: Sat Apr 9 08:34:06 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | T | I | T | L | P | C | R | P | A | P | P | P | H | C | S | S | N | I | T | G | L | I | L | T | R | Q | G | G | Y | A | N | T | V | I | F | R | P | S | G | G | D | W | R | D | I | A | R | C | Q | I | A | G | T | V | V | S | T | Q | L | F | L | N | G | S | L | A | E | E | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | S | S | S | B | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | V | I | R | S | E | D | W | R | D | N | A | K | S | I | C | V | Q | L | A | T | S | V | E | I | A | C | T | G | A | G | H | C | A | I | S | R | A | K | W | A | N | T | L | K | Q | I | A | S | K | L | R | E | Q | Y | G | A | K | T | I | I | F | K | P | S | S | G | G | D | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | F | V | N | H | S | F | N | C | G | G | E | F | F | Y | C | A | S | T | Q | L | F | A | S | T | W | F | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | G | G | G | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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