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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5ee4A_ | PDB header: metal transport | Chain: A: PDB Molecule: hpua; | PDBTitle: the crystal structure of hpua from kingella denitrificans in complex2 with human haemoglobin |
Added to library: Sat Nov 7 08:17:35 2015 | |
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Sequence | P | I | P | V | L | R | A | V | D | T | T | S | P | N | I | V | A | D | T | S | T | D | R | E | Q | R | T | F | A | T | Q | G | G | S | V | K | P | F | T | I | T | K | P | S | P | Y | I | P | G | L | M | L | T | N | Q | E | I | L | Y | Q | A | P | D | G | K | Y | Y | D | F | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | T | T | G | G | G | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | Y | N | T | L | I | M | P | S | S | S | T | S | A | R | V | L | P | N | S | H | P | M | Q | P | L | D | S | G | G | K | M | I | A | C | C | T | N | Q | T | S | T | G | M | N | A | L | R | L | K | S | M | Q | F | G | A | W | M | S | P | S | K | T | V | S | L | F | A | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | B | S | S | S | B | S | B | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | P | A | P | T | D | T | L | Q | G | V | D | T | A | G | R | P | T | G | K | A | T | Y | E | V | I | G | L | R | V | K | N | D | R | A | V | T | S | S | Y | E | T | V | V | T | G | S | F | L | T | V | N | F | N | T | G | K | L | G | G | T | I | V | G | N | S | E | F | G | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | S | T | T | S | S | S | S | S | B | B | T | T | T | T | B | T | T | T | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | I | E | M | R | D | V | N | V | N | G | N | Q | F | S | G | T | A | S | S | G | G | H | T | G | Q | V | S | G | G | L | F | A | K | E | E | R | F | Y | S | G | T | L | E | H | P | S | G | G | E | I | G | G | T | V | N | F | G | S | N | S | P | L | N | A | S | F | G | G | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | R | E | Y | N | A | A | D | T | S | T | D | T | S | H | L | V | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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