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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5dseB_ | PDB header: protein binding | Chain: B: PDB Molecule: hyccin; | PDBTitle: crystal structure of the ttc7b/hyccin complex |
Added to library: Sat Dec 5 08:13:33 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | V | V | E | E | W | L | S | E | P | N | Y | A | T | S | L | V | S | S | L | Y | K | V | I | Q | E | P | L | E | P | V | C | H | Q | L | F | E | F | Y | R | S | G | E | E | Q | L | L | Q | F | T | L | Q | F | L | P | E | L | I | W | C | Y | L | A | V | S | A | S | G | C | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | A | L | L | L | G | V | Y | N | L | E | I | K | V | L | S | F | T | I | P | S | L | S | K | P | S | V | Y | H | E | P | S | K | V | V | Y | S | G | P | H | P | Q | R | E | M | L | T | A | Q | N | R | F | E | V | L | T | F | L | L | L | C | Y | N | A | A | L | T | Y | M | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | V | S | L | Q | S | L | C | Q | I | C | S | R | I | C | V | C | G | Y | P | R | Q | H | V | R | K | Y | K | G | I | S | S | R | I | P | V | S | S | G | F | M | V | Q | M | L | T | G | I | Y | F | A | F | Y | N | G | E | W | D | L | A | Q | K | A | L | D | D | I | I | Y | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | Q | L | E | L | Y | P | E | P | L | L | V | A | N | A | I | K | A | S | L | P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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