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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5d5nB_ | PDB header: viral protein | Chain: B: PDB Molecule: virion egress protein ul31 homolog; | PDBTitle: crystal structure of the human cytomegalovirus pul50-pul53 complex |
Added to library: Sat Oct 10 08:16:58 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | T | L | H | D | L | H | D | I | F | R | E | H | P | E | L | E | L | K | Y | L | N | M | M | K | M | A | I | T | G | K | E | S | I | C | L | P | F | N | F | H | S | H | R | Q | H | T | C | L | D | I | S | P | Y | G | N | E | Q | V | S | R | I | A | C | T | S | C | E | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | T | A | S | D | A | M | V | A | F | I | N | Q | T | S | N | I | M | K | N | R | N | F | Y | Y | G | F | C | K | S | S | E | L | L | K | L | S | T | N | Q | P | P | I | F | Q | I | Y | Y | L | L | H | A | A | N | H | D | I | V | P | F | M | H | A | E | D | G | R | L | H | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | H | V | I | F | E | N | P | D | V | H | I | P | C | D | C | I | T | Q | M | L | T | A | A | R | E | D | Y | S | V | T | L | N | I | V | R | D | H | V | V | I | S | V | L | C | H | A | V | I | D | V | T | I | L | Q | R | K | I | D | E | M | D | I | P | N | D | V | S | E | S | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | R | Y | K | E | L | I | Q | E | L | C | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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