|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c5d1mB_ | PDB header: ligase | Chain: B: PDB Molecule: e3 ubiquitin-protein ligase rnf25; | PDBTitle: crystal structure of ubch5b in complex with the ring-u5br fragment of2 ao7 (p199a) |
Added to library: Sat Oct 31 08:27:56 2015 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | N | I | P | H | G | Q | C | V | I | C | L | Y | G | F | Q | E | K | E | A | F | T | K | T | P | C | Y | H | Y | F | H | C | H | C | L | A | R | Y | I | Q | H | M | E | Q | E | L | K | A | Q | G | G | V | Q | C | A | V | C | R | E | P | L | V | Y | D | L | A | S | L | K | A | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | T | B | T | T | T | T | S | B | T | T | T | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | |||||||||||
Sequence | P | E | P | Q | Q | P | M | E | L | Y | Q | P | S | A | E | S | L | R | Q | Q | E | E | R | K | R | L | Y | Q | R | Q | Q | E | R | G | G | I | I | D | L | E | ||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|