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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5cqsC_ | PDB header: protein binding | Chain: C: PDB Molecule: elongator complex protein 1; | PDBTitle: dimerization of elp1 is essential for elongator complex assembly |
Added to library: Sat Aug 22 08:24:23 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | D | V | N | V | V | Y | K | S | A | L | S | L | Y | D | V | S | L | A | L | L | V | A | Q | K | S | Q | X | D | P | R | E | Y | L | P | F | L | Q | E | L | Q | D | N | E | P | L | R | R | K | F | L | I | D | D | Y | L | G | N | Y | E | K | A | L | E | H | L | S | E | I | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | D | G | N | V | S | E | E | V | I | D | Y | V | E | S | H | D | L | Y | K | H | G | L | A | L | Y | R | Y | D | S | E | K | Q | N | V | I | Y | N | I | Y | A | K | H | L | S | S | N | Q | X | Y | T | D | A | A | V | A | Y | E | X | L | G | K | L | K | E | A | X | G | A | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | S | A | K | R | W | R | E | A | X | S | I | A | V | Q | K | F | P | E | E | V | E | S | V | A | E | E | L | I | S | S | L | T | F | E | H | R | Y | V | D | A | A | D | I | Q | L | E | Y | L | D | N | V | K | E | A | V | A | L | Y | C | K | A | Y | R | Y | D | I | A | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | A | I | K | A | K | K | D | E | L | L | E | E | V | V | D | P | G | L | G | E | G | F | G | I | I | A | E | L | L | A | D | C | K | G | Q | I | Y | L | V | Q | S | V | G | R | L | I | E | R | L | N | Q | T | K | P | D | A | V | R | V | V | E | G | L | C | R | R | N | X | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | |||||||||||||||||||||
Sequence | E | Q | A | H | Q | I | Q | K | N | F | V | E | V | L | D | L | L | K | A | N | E | I | H | D | F | P | K | S | H | I | V | D | F | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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