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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5afrB_ | PDB header: motor protein | Chain: B: PDB Molecule: dynein heavy chain, cytoplasmic; | PDBTitle: n-terminal fragment of dynein heavy chain |
Added to library: Sat Feb 21 08:17:20 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | L | A | N | E | L | I | E | F | V | A | A | T | V | T | G | I | K | N | S | P | K | E | N | E | Q | A | F | I | D | Y | L | H | C | Q | Y | L | E | R | F | Q | F | F | L | G | L | F | V | F | L | F | I | V | T | I | D | I | A | I | Y | D | A | N | L | A | N | S | T | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | I | Q | I | S | A | I | Y | N | A | G | N | L | A | S | I | I | T | H | G | V | S | S | V | F | G | Q | L | I | K | S | I | D | K | T | R | R | K | L | D | D | I | S | K | Q | F | Q | Q | L | H | T | S | I | E | T | P | D | L | L | A | X | V | P | S | I | I | K | L | A | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | K | G | A | T | S | H | D | Y | A | N | Y | L | P | S | N | D | L | E | S | X | R | F | L | N | I | L | Q | S | I | A | N | K | W | F | L | V | L | K | Q | T | F | L | D | E | V | E | F | W | S | N | F | Y | E | V | L | K | S | L | I | E | Q | T | Q | S | Q | E | F | Q | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | C | L | S | V | L | T | N | A | K | R | F | H | N | L | T | N | L | L | N | E | G | S | L | S | D | K | F | K | L | A | D | K | Y | N | Q | F | L | S | S | I | P | I | D | E | D | L | Q | E | L | F | P | V | L | A | S | S | L | K | K | F | R | Y | S | G | Y | P | V | Q | R | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | |||||||||
Sequence | V | V | L | X | D | K | I | S | Q | E | V | X | D | A | I | L | S | N | L | S | Y | G | S | F | L | G | L | Y | E | K | S | A | G | X | I | E | E | W | D | D | I | V | Q | D | V | N | L | L | I | R | ||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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