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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5afoA_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: fimbriae; | PDBTitle: long polar fimbriae adhesin lpfd from the adherent invasive2 e. coli strain lf82 |
Added to library: Sat Aug 8 08:25:51 2015 | |
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Sequence | A | D | W | G | P | C | R | T | A | S | G | D | P | F | I | F | V | T | S | F | T | K | N | I | Q | N | P | T | D | N | V | T | G | Q | T | Y | P | D | F | Y | Q | W | A | L | G | D | K | Y | S | G | V | C | E | C | P | S | P | N | P | T | E | A | R | P | T | L | Y | K | T | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | S | S | S | G | G | G | S | T | T | S | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | T | L | A | A | G | H | N | S | T | Y | F | K | I | T | N | N | L | E | V | S | T | R | V | Y | I | A | N | V | G | N | V | Q | V | P | F | I | N | K | S | N | S | Q | P | G | R | E | C | D | Q | P | T | F | G | W | T | T | G | S | K | G | Q | L | S | L | Y | I | A | K | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | S | S | B | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | V | G | E | Q | N | I | P | Q | T | I | I | V | S | V | F | G | T | K | K | E | N | V | Y | S | S | V | P | I | S | Q | V | L | L | S | G | K | V | T | V | T | Q | G | C | E | L | A | A | G | T | S | L | D | I | D | F | G | E | Y | Q | A | H | D | F | K | G | R | T | G | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | G | G | G | T | T | T | B | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | P | P | Q | N | V | Q | K | I | Q | K | E | L | T | F | N | C | T | N | I | S | D | G | V | H | I | Y | L | S | L | E | G | T | P | N | A | A | Y | P | S | A | I | S | L | G | N | A | D | V | G | A | V | I | E | D | G | K | G | N | I | L | K | P | N | D | S | N | S | L | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | B | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | B | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . |
Sequence | M | N | P | G | S | L | Y | E | Y | V | K | R | K | V | T | T | T | I | T | A | Y | P | V | S | T | T | G | K | L | P | A | A | G | D | Y | S | G | V | A | T | M | H | V | E | L | D | T | T | D | L | G | A | K | G | T | L | K | F | S | L | K | I | S | |||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | B | T | T | T | S | S | S | S | S |
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