|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c5a9qK_ | PDB header: transport protein | Chain: K: PDB Molecule: nucleoporin nup37; | PDBTitle: human nuclear pore complex |
Added to library: Sat Oct 3 09:29:46 2015 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | A | A | Y | T | V | D | C | E | D | Y | V | H | V | V | E | F | N | P | F | E | N | G | D | S | G | N | L | I | A | Y | G | G | N | N | Y | V | V | I | G | T | C | T | F | Q | E | E | E | A | D | V | E | G | I | Q | Y | K | T | L | R | T | F | H | H | G | V | R | V | D | G | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | W | S | P | E | T | R | L | D | S | L | P | P | V | I | K | F | C | T | S | A | A | D | M | K | I | R | L | F | T | S | D | L | Q | D | K | N | E | Y | K | V | L | E | G | H | T | D | F | I | N | G | L | V | F | D | P | K | E | G | Q | E | I | A | S | V | S | D | D | H | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | C | R | I | W | N | L | E | G | V | Q | T | A | H | F | V | L | H | S | P | G | M | S | V | C | W | H | P | E | E | T | F | K | L | M | V | A | E | K | N | G | T | I | R | F | Y | D | L | L | A | Q | Q | A | I | L | S | L | E | S | E | Q | V | P | L | M | S | A | H | W | C | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | N | T | F | K | V | G | A | V | A | G | N | D | W | L | I | W | D | I | T | R | S | S | Y | P | Q | N | K | R | P | V | H | M | D | R | A | C | L | F | R | W | S | T | I | S | E | N | L | F | A | T | T | G | Y | P | G | K | M | A | S | Q | F | Q | I | H | H | L | G | H | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||
Sequence | Q | P | I | L | M | G | S | V | A | V | G | S | G | L | S | W | H | R | T | L | P | L | C | V | I | G | G | D | H | K | L | L | F | W | V | T | E | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|