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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5a9bA_ | PDB header: viral protein | Chain: A: PDB Molecule: polyhedrin; | PDBTitle: crystal structure of bombyx mori cpv1 polyhedra base domain2 deleted mutant |
Added to library: Sat Sep 5 08:17:27 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | N | R | D | F | R | G | R | E | Q | R | L | F | N | S | E | Q | Y | N | Y | N | S | S | L | N | G | E | V | S | V | W | V | Y | A | Y | Y | S | D | G | S | V | L | V | I | N | K | N | S | Q | Y | K | V | G | I | S | E | T | F | K | V | L | K | E | G | S | G | A | K | P | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | I | Q | I | I | F | S | P | S | V | N | V | R | T | I | K | M | A | K | G | N | A | V | S | V | P | D | E | Y | L | Q | R | S | H | P | W | E | A | T | G | I | K | Y | R | K | I | K | R | D | G | E | I | V | G | Y | S | H | Y | F | E | L | P | H | E | Y | N | S | I | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | G | G | G | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | B | G | G | G | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | A | V | S | G | V | H | K | N | P | S | S | Y | N | V | G | S | A | H | N | V | M | D | V | F | Q | S | C | D | L | A | L | R | F | C | N | R | Y | W | A | E | L | E | L | V | N | H | Y | I | S | P | N | A | Y | P | Y | L | D | I | N | N | H | S | Y | G | V | A | L | S | N | |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | T | S | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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