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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c5a63B_ | PDB header: hydrolase | Chain: B: PDB Molecule: presenilin-1; | PDBTitle: cryo-em structure of the human gamma-secretase complex at 3.42 angstrom resolution. |
Added to library: Sat Aug 8 08:27:27 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | A | K | H | V | I | M | L | F | V | P | V | T | L | C | M | V | V | V | V | A | T | I | K | S | V | S | F | Y | T | R | I | I | S | S | L | L | L | L | F | F | F | S | F | I | Y | L | G | E | V | F | K | T | Y | N | V | A | V | D | Y | I | T | V | A | L | L | I | W | N | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | V | V | G | M | I | S | I | H | W | K | G | P | L | R | L | Q | Q | A | Y | L | I | M | I | S | A | L | M | A | L | V | F | I | K | Y | L | P | E | W | T | A | W | L | I | L | A | V | I | S | V | Y | D | L | V | A | V | V | K | L | G | L | G | D | F | I | F | Y | S | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | G | K | A | S | A | T | A | S | G | D | W | N | T | T | I | A | C | F | V | A | I | L | I | G | L | C | L | T | L | L | L | L | A | I | F | K | K | A | L | P | A | L | P | I | S | I | T | F | G | L | V | F | Y | F | A | T | D | Y | L | V | Q | P | F | M | D | Q | L | A | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | H | Q | F | Y | I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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