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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4zplA_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: protein pcdhb1; | PDBTitle: crystal structure of protocadherin beta 1 ec1-3 |
Added to library: Sat Oct 31 09:17:17 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | T | I | R | Y | S | V | A | E | E | M | E | S | G | S | F | V | A | N | V | A | K | D | L | G | L | E | V | G | K | L | A | E | R | G | A | R | L | V | A | E | G | N | R | L | H | F | R | L | H | R | K | T | G | D | L | F | V | K | E | K | L | D | R | E | A | L | C | G | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | G | G | G | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | D | P | C | V | L | H | F | E | I | I | L | A | E | P | L | Q | S | F | R | V | E | V | R | V | F | D | I | N | D | N | A | P | V | F | L | N | K | E | P | L | L | K | I | P | E | S | T | P | L | G | S | R | F | P | L | Q | S | A | Q | D | L | D | V | G | L | N | G | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | B | S | S | S | S | S | T | T | B | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | Y | T | L | S | A | N | T | Y | F | H | L | H | T | R | F | R | S | H | G | P | K | Y | A | E | L | V | L | D | N | P | L | D | R | E | A | Q | P | E | V | N | L | T | I | T | A | V | D | G | G | S | P | P | K | S | G | T | A | N | I | R | V | V | V | L | D | V | N | D | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | P | Q | F | S | R | L | V | Y | R | A | Q | V | P | E | N | S | D | N | G | S | L | V | V | V | V | T | A | T | D | L | D | E | G | T | N | K | Q | I | T | Y | S | L | A | E | N | P | E | A | V | L | R | T | F | L | V | D | P | Q | T | G | E | V | R | L | R | G | P | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||
Sequence | F | E | M | I | E | T | Y | D | I | D | I | Q | A | T | D | G | G | G | L | S | A | H | S | K | V | L | V | E | V | V | D | V | N | D | H | H | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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