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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4z8nB_ | PDB header: cell invasion | Chain: B: PDB Molecule: reticulocyte-binding protein 2a; | PDBTitle: crystal structure of the erythrocyte-binding domain from plasmodium2 vivax reticulocyte-binding protein 2a (pvrbp2a) |
Added to library: Sat Dec 19 08:18:30 2015 | |
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Sequence | D | I | L | R | Y | L | D | F | S | N | S | S | G | Q | I | I | S | T | V | Y | P | F | Y | V | Q | M | N | Y | F | A | E | I | K | Y | Y | I | T | Y | H | Y | E | A | K | K | N | Y | D | E | A | Y | N | Q | S | V | N | P | L | M | S | S | I | Q | N | Q | I | N | S | C | V | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | K | A | A | L | E | K | T | I | F | V | L | E | Y | P | E | N | H | N | I | N | L | S | N | Y | E | A | K | H | N | E | Y | K | Q | Q | L | D | A | Y | K | N | C | V | Q | A | N | M | E | S | Y | T | D | R | M | S | K | F | N | E | K | I | Y | S | I | L | N | S | V | K | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | D | A | C | E | T | D | T | Y | E | I | M | L | E | I | Y | V | E | R | V | K | E | V | N | H | N | N | Y | V | N | Y | L | S | T | L | K | A | S | L | Q | L | G | V | T | L | M | L | K | V | K | Q | E | I | D | N | N | V | T | I | S | A | I | N | F | L | Q | E | E | M | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | I | I | T | I | G | E | A | H | T | G | K | I | I | H | G | K | E | N | V | L | K | P | Q | V | P | L | S | T | L | K | K | L | Y | F | D | S | A | N | F | Y | A | T | Y | K | F | S | L | K | R | A | D | T | T | T | A | A | L | K | E | K | G | K | L | L | A | N | L | Y | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |   | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | L | I | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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