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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4xupD_ | PDB header: sugar binding protein | Chain: D: PDB Molecule: endo-1,4-beta-xylanase c; | PDBTitle: structure of the n-terminal cbm22-1-cbm22-2 tandem domain from2 paenibacillus barcinonensis xyn10c |
Added to library: Sat Jun 6 08:17:32 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | S | A | A | K | A | G | D | I | L | L | S | H | S | F | E | E | G | T | T | Q | G | W | T | A | R | G | G | V | K | V | D | V | T | A | E | Q | A | Y | Q | G | K | Q | S | L | Q | T | T | G | R | T | E | A | W | N | G | P | S | L | S | L | T | D | V | V | H | K | N | E | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | E | I | S | G | Y | V | K | L | V | A | G | S | A | P | A | D | L | K | F | T | V | E | R | R | D | G | N | G | D | T | Q | Y | D | Q | V | N | A | A | E | Q | V | T | D | Q | K | W | V | K | L | Q | G | Q | Y | S | Y | E | Q | G | S | S | L | L | L | Y | L | E | S | T | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | K | A | A | Y | L | L | D | E | F | Q | I | R | L | V | K | A | A | P | Q | A | L | F | K | A | D | F | E | D | G | N | I | G | N | W | R | A | R | G | T | E | K | L | E | V | V | S | G | I | G | H | N | S | N | R | S | L | K | T | S | S | R | S | E | T | Y | H | G | P | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | B | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | E | V | L | P | Y | L | Q | K | G | S | T | V | H | I | S | F | W | A | M | Y | D | E | G | P | A | T | Q | V | I | N | G | S | L | E | K | E | F | N | R | D | T | A | N | L | E | Y | A | M | F | A | S | T | T | L | N | K | G | Q | W | K | K | I | E | A | D | I | I | V | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | |||||||||||
Sequence | A | E | S | T | G | I | S | G | L | R | M | Y | A | E | T | P | W | K | Q | S | S | E | V | T | E | T | D | T | I | P | F | Y | V | D | D | V | Q | I | T | A | T | |||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | G | G | G | T | T | T | T |
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