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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4x2hA_ | PDB header: transcription | Chain: A: PDB Molecule: putative mrna export protein; | PDBTitle: sac3n peptide bound to mex67:mtr2 |
Added to library: Sat Jun 20 08:31:13 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | T | P | L | P | Q | L | P | S | N | V | R | D | G | E | N | N | V | A | S | T | F | L | Q | A | F | F | Q | L | W | D | H | D | R | L | T | L | I | P | Q | F | Y | D | S | E | T | T | F | S | V | V | F | A | T | D | S | P | Q | D | P | A | S | S | S | C | S | K | F | S | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | L | N | I | L | S | P | R | H | P | S | T | L | Q | R | L | F | V | G | S | N | L | I | A | D | L | W | K | V | L | P | A | T | R | H | P | S | L | D | Q | T | S | Q | W | L | I | D | C | H | T | F | P | H | L | A | D | P | T | G | M | A | P | Y | A | M | G | L | M | I | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | T | T | G | G | G | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . |
Sequence | V | N | G | Q | C | E | E | A | D | I | S | Q | N | L | Y | G | T | R | T | F | S | R | C | F | I | L | G | P | S | K | P | G | A | P | H | P | Y | R | V | L | S | D | Q | L | T | L | H | T | W | K | P | Q | ||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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