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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4v3eA_ | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: it4var07 cidra; | PDBTitle: the cidra domain from it4var07 pfemp1 bound to endothelial2 protein c receptor |
Added to library: Sat Dec 20 08:21:45 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | D | V | K | T | T | E | I | N | V | I | V | S | G | D | E | Q | G | I | I | T | K | K | L | Q | D | F | C | M | N | P | N | N | E | N | G | T | N | N | Q | I | W | K | C | Y | Y | K | D | E | K | E | D | K | C | K | V | K | E | K | I | T | S | F | D | E | F | F | D | F | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | - | S | S | S | S | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | R | K | L | L | I | D | T | I | K | W | E | T | E | L | T | Y | C | I | N | A | D | C | N | N | E | C | N | K | N | C | V | C | F | D | K | W | V | K | Q | K | E | K | E | W | K | N | I | M | D | L | F | T | N | K | H | D | I | P | K | K | Y | Y | L | N | I | N | D | L | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | S | G | G | G | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | |
Sequence | N | S | F | F | F | Q | V | I | Y | K | F | N | E | G | E | A | K | W | N | K | L | K | E | N | L | K | K | K | T | E | A | A | I | K | V | L | F | D | H | L | K | E | T | A | T | I | C | K | D | N | N | T | ||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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