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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4u6uB_ | PDB header: transport protein | Chain: B: PDB Molecule: cog5; | PDBTitle: crystal structure of the cog5-cog7 complex from kluyveromyces lactis |
Added to library: Sat Oct 25 09:11:02 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | D | I | L | E | P | F | E | R | A | L | K | L | Q | T | V | S | S | K | I | H | Q | T | T | T | L | L | R | S | S | L | I | Y | V | H | M | I | S | Q | L | Q | M | M | P | L | E | T | D | S | T | D | D | A | A | L | A | C | G | L | K | I | A | A | L | H | S | Q | L | K | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | I | A | A | N | P | N | L | A | T | L | Q | L | I | K | S | C | E | N | N | V | V | S | P | N | R | Q | E | L | L | R | Y | L | S | T | N | L | T | R | D | C | L | N | N | L | K | M | E | N | N | P | K | R | I | V | T | L | I | K | A | L | Y | T | L | S | P | V | D | L | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | T | I | D | K | V | L | S | S | K | I | Q | T | T | A | Q | V | L | S | K | T | I | T | S | I | R | N | F | N | L | S | L | D | D | A | M | E | N | R | N | S | I | L | T | L | Q | N | L | M | A | A | C | A | I | E | G | N | T | N | T | L | R | N | Y | L | S | Q | R | K | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | G | G | G | S | T | T | T | T | T | S | B | S | S | S | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | S | L | I | D | Q | F | W | S | K | V | T | N | S | F | K | R | D | F | E | M | S | Y | N | R | G | G | P | V | G | K | S | L | Q | S | N | S | N | L | I | Y | E | A | I | S | K | C | F | G | E | N | D | P | S | N | E | L | Q | G | E | L | Q | Y | I | L | K | A | V | S | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | S | S | S | S | S | T | T | S | T |   | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
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