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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4tsdB_ | PDB header: unknown function | Chain: B: PDB Molecule: hp1029; | PDBTitle: crystal structure of helicobacter pylori hp1029 |
Added to library: Sat Jun 13 08:29:26 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | I | F | G | E | L | S | S | L | G | H | L | F | K | K | T | Q | E | L | E | I | L | H | E | Y | L | K | E | V | M | Q | K | G | S | K | A | N | Q | R | V | L | N | L | A | T | N | T | E | F | Q | V | P | L | G | H | G | I | F | S | I | E | Q | S | Y | C | L | E | H | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | G | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | S | E | K | G | F | F | E | S | H | K | K | Y | V | D | F | Q | L | I | V | K | G | V | E | G | A | K | A | V | G | I | N | Q | A | V | I | K | N | P | Y | D | E | K | R | D | L | I | V | Y | E | P | V | S | E | A | S | F | L | R | L | H | A | G | M | L | A | I | F | F | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | ||||||||
Sequence | N | D | A | H | A | L | R | F | Y | G | E | S | F | E | K | Y | R | E | E | P | I | F | K | A | V | V | K | A | P | K | G | L | I | K | L | K | L | A | A | E | N | |||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | G | G | G | G | T | S | G | G | G | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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