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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4rswB_ | PDB header: signaling protein | Chain: B: PDB Molecule: hopa1; | PDBTitle: the structure of the effector protein from pseudomonas syringae pv.2 syringae strain 61 |
Added to library: Sat Mar 14 08:17:47 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | L | T | S | K | Q | T | F | A | S | F | Q | Q | W | A | E | K | A | E | A | L | G | R | D | T | E | I | G | I | Y | X | I | Y | K | R | D | T | P | D | T | T | P | X | N | A | A | E | Q | E | H | Y | L | E | T | L | Q | A | L | D | N | K | K | N | L | I | I | R | P | Q | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | T | T | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | D | D | R | E | E | E | E | L | D | L | G | R | Y | I | A | E | D | R | N | A | R | T | G | F | F | R | X | V | P | K | D | Q | R | A | P | E | T | N | S | G | R | L | T | I | G | V | E | P | K | Y | G | A | Q | L | A | L | A | X | A | T | L | X | D | K | H | K | S | V | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | T | T | S | G | G | G | G | G | G | G | T | S | S | S | S | S | B | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | G | K | V | V | G | P | A | K | Y | G | Q | Q | T | D | S | A | I | L | Y | I | N | G | D | L | A | K | A | V | K | L | G | E | K | L | K | K | L | S | G | I | P | P | E | G | F | V | E | H | T | P | L | S | X | Q | S | T | G | L | G | L | S | Y | A | E | S | V | E | G | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | T | G | G | G | B | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | ||
Sequence | P | S | S | H | G | Q | A | R | T | H | V | I | X | D | A | L | K | G | Q | G | P | X | E | N | R | L | K | X | A | L | A | E | R | G | Y | D | P | E | N | P | A | L | R | A | R | |||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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