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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4pkeA_ | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: protein c10c5.1, isoform i; | PDBTitle: the structure of a conserved piezo channel domain reveals a novel beta2 sandwich fold |
Added to library: Sat Oct 11 08:23:34 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | K | V | T | L | R | I | S | I | E | G | Y | P | P | L | Y | E | M | E | A | Q | D | N | A | E | L | G | M | I | K | P | D | Q | L | A | S | L | N | Q | A | L | T | K | G | Y | T | Y | E | D | I | L | I | V | R | F | R | P | E | S | E | I | Y | W | P | I | S | Q | D | S | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | G | G | G | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | A | M | I | D | K | L | S | R | N | T | S | V | N | F | E | V | S | L | E | F | K | H | S | K | S | W | L | V | P | I | S | L | D | M | T | I | R | A | K | I | Q | S | A | L | R | G | D | P | G | H | P | I | L | I | P | Q | S | I | P | A | F | I | Q | V | P | N | Q | G | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | T | L | P | T | S | I | G | N | T | I | I | A | R | A | W | F | D | S | L | T | L | N | L | E | Q | G | K | S | Q | N | E | K | M | W | I | A | T | S | E | H | P | G | D | Q | N | A | K | L | W | I | K | T | A | N | T | T | Y | S | G | R | P | Y | L | Q | V | V | G | F | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | B | T | T | T | B |   | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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