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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4oq1A_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: cell wall surface anchor family protein; | PDBTitle: structure of the streptococcal ancillary pilin |
Added to library: Sat Apr 26 08:19:23 2014 | |
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Sequence | E | D | H | T | L | V | L | Q | L | E | N | Y | Q | E | V | V | S | Q | L | P | S | R | D | G | H | R | L | Q | V | W | K | L | D | D | S | Y | S | Y | D | D | R | V | Q | I | V | R | D | L | H | S | W | D | E | N | K | L | S | S | F | K | K | T | S | F | E | M | T | F | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | T | T | G | G | G | S | S | G | G | G | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | Q | I | E | V | S | H | I | P | N | G | L | Y | Y | V | R | S | I | I | Q | T | D | A | V | S | Y | P | A | E | F | L | F | E | M | T | D | Q | T | V | E | P | L | V | I | V | A | K | K | T | D | T | M | T | T | K | V | K | L | I | K | V | D | Q | D | H | N | R | L | E | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | G | F | K | L | V | S | V | A | R | D | V | S | A | A | A | V | P | L | I | G | E | Y | R | Y | S | S | S | G | Q | V | G | R | T | L | Y | T | D | K | N | G | E | I | F | V | T | N | L | P | L | G | N | Y | R | F | K | E | V | E | P | L | A | G | Y | A | V | T | T | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | B | S | T | T | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | D | V | Q | L | V | D | H | Q | L | V | T | I | T | V | V | N | Q | K | L | P | R | G | N | V | D | F | M | K | V | D | G | R | T | N | T | S | L | Q | G | A | M | F | K | V | M | K | E | E | S | G | H | Y | T | P | V | L | Q | N | G | K | E | V | V | V | T | S | G | K | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | T | T | T | B | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | |||
Sequence | G | R | F | R | V | E | G | L | E | Y | G | T | Y | Y | L | W | E | L | Q | A | P | T | G | Y | V | Q | L | T | S | P | V | S | F | T | I | G | K | D | E | L | V | T | V | V | K | N | N | K | R | P | R | |||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | T | T | B | S | S | S | B |
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