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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ngdA_ | PDB header: hydrolase/rna | Chain: A: PDB Molecule: endoribonuclease dicer; | PDBTitle: structure of human dicer platform-paz-connector helix cassette in2 complex with 12-mer sirna having 5'-p and uu-3' ends (1.95 angstrom3 resolution) |
Added to library: Sat Mar 8 08:14:24 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | P | C | Y | L | Y | V | I | G | M | V | L | T | T | P | L | P | D | E | L | N | F | R | R | R | K | L | Y | P | P | E | D | T | T | R | C | F | G | I | L | T | A | K | P | I | P | Q | I | P | H | F | P | V | Y | T | R | S | G | E | V | T | I | S | I | E | L | A | A | S | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | G | G | G | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | M | L | S | L | Q | M | L | E | L | I | T | R | L | H | Q | Y | I | F | S | H | I | L | R | L | E | K | P | A | L | A | Y | C | V | L | P | L | N | V | V | S | S | T | L | D | I | D | F | K | F | M | E | D | I | E | K | S | E | A | R | I | G | I | P | S | T | K | Y | T | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | T | P | F | V | F | K | L | E | D | Y | Q | D | A | V | I | I | P | R | Y | R | N | F | D | Q | P | H | R | F | Y | V | A | D | V | Y | T | D | L | T | P | L | S | K | F | P | S | P | E | Y | E | T | F | A | E | Y | Y | K | T | K | Y | N | L | D | L | T | N | L | N | Q | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | B | S | S | T | T | S | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | L | D | V | D | H | T | S | S | R | L | N | L | L | T | P | R | H | L | P | L | S | S | A | E | K | R | K | A | K | W | E | S | L | Q | N | K | Q | I | L | V | P | E | L | C | A | I | H | P | I | P | A | S | L | W | R | K | A | V | C | L | P | S | I | L | Y | R | L | H | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | S | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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