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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4mxwR_ | PDB header: cytokine/immune system | Chain: R: PDB Molecule: tumor necrosis factor receptor superfamily member 3; | PDBTitle: structure of heterotrimeric lymphotoxin lta1b2 bound to lymphotoxin2 beta receptor ltbr and anti-lta fab |
Added to library: Sat Nov 16 08:51:59 2013 | |
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Sequence | C | R | D | Q | E | K | E | Y | Y | E | P | Q | H | R | I | C | C | S | R | C | P | P | G | T | Y | V | S | A | K | C | S | R | I | R | D | T | V | C | A | T | C | A | E | N | S | Y | N | E | H | W | N | Y | L | T | I | C | Q | L | C | R | P | C | D | P | V | E | I | A | P | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | B | B | T | T | T | T | B | B | B | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | S | K | R | K | T | Q | C | R | C | C | C | T | H | C | E | L | L | S | D | C | P | P | G | T | E | A | V | G | K | G | N | N | H | C | V | P | C | K | A | G | H | F | Q | N | T | S | S | P | S | A | R | C | Q | P | H | T | R | C | E | N | Q | G | L | V | E | A | A | P | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | A | Q | S | D | T | T | C | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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