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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4mjfA_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: A: PDB Molecule: hypothetical protein; | PDBTitle: crystal structure of a hypothetical protein (bvu_2238) from2 bacteroides vulgatus atcc 8482 at 1.99 a resolution |
Added to library: Sat Nov 16 08:48:15 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | D | E | S | F | A | D | F | F | Y | N | F | A | S | D | E | K | L | Q | L | S | R | I | V | F | P | L | P | Y | Y | T | X | E | K | K | E | H | I | E | K | D | Q | W | K | H | D | P | L | F | S | R | Q | D | A | Y | T | V | L | F | D | K | A | E | D | X | E | X | D | T | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | S | S | T | T | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | S | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | T | S | V | K | I | E | W | I | Y | L | K | K | G | K | I | K | R | Y | Y | F | E | R | L | K | G | L | W | K | L | E | A | I | D | F | A | D | X | P | R | E | D | T | G | K | E | D | F | F | E | F | Y | E | R | F | A | N | D | S | V | F | Q | L | S | R | L | H | E | P | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | F | V | T | A | D | P | E | D | E | F | Q | I | L | E | T | T | L | E | A | G | Q | W | F | A | F | Q | P | V | L | P | R | E | N | L | T | N | V | N | Y | G | Q | N | E | N | V | H | S | N | T | K | V | I | E | X | K | G | F | G | N | G | F | N | N | T | L | Y | F | E | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | H | G | L | W | K | L | X | Q | F | E | D | L | S | D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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