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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4m4eB_ | PDB header: signaling protein | Chain: B: PDB Molecule: tnf receptor-associated factor 4; | PDBTitle: traf domain of human traf4 |
Added to library: Sat Sep 14 08:28:16 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | L | E | E | L | S | V | G | S | D | G | V | L | I | W | K | I | G | S | Y | G | R | R | L | Q | E | A | K | A | K | P | N | L | E | C | F | S | P | A | F | Y | T | H | K | Y | G | Y | K | L | Q | V | S | A | F | L | N | G | N | G | S | G | E | G | T | H | L | S | L | Y | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | B | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | V | L | P | G | A | F | D | N | L | L | E | W | P | F | A | R | R | V | T | F | S | L | L | D | Q | S | D | P | G | K | P | Q | H | V | T | E | T | F | H | P | D | P | N | W | K | N | F | Q | K | P | G | T | W | R | G | S | L | D | E | S | S | L | G | F | G | Y | P | K | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | S | T | T | G | G | G | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | S | H | Q | D | I | R | K | R | N | Y | V | R | D | D | A | V | F | I | R | A | A | V | E | L | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | S | B | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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