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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4lqqD_ | PDB header: transferase/transferase activator | Chain: D: PDB Molecule: serine/threonine-protein kinase cbk1; | PDBTitle: crystal structure of the cbk1(t743e)-mob2 kinase-coactivator complex2 in crystal form b |
Added to library: Sat Aug 2 09:05:50 2014 | |
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Sequence | Y | Q | S | S | V | K | Y | A | I | E | R | N | E | R | R | V | E | L | E | T | E | L | T | S | H | N | W | S | E | E | R | K | S | R | Q | L | S | S | L | G | K | K | E | S | Q | F | L | R | L | R | R | T | R | L | S | L | E | D | F | H | T | V | K | V | I | G | K | G | A | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | E | V | R | L | V | Q | K | K | D | T | G | K | I | Y | A | M | K | T | L | L | K | S | E | M | Y | K | K | S | D | S | P | W | V | V | S | L | Y | Y | S | F | Q | D | A | Q | Y | L | Y | L | I | M | E | F | L | P | G | G | D | L | M | T | M | L | I | R | W | Q | L | F | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | D | V | T | R | F | Y | M | A | E | C | I | L | A | I | E | T | I | H | K | L | G | F | I | H | R | A | I | K | P | D | N | I | L | I | D | I | R | G | H | I | K | L | S | D | F | G | D | Y | I | A | P | E | I | F | L | Y | Q | G | Y | G | Q | E | C | D | W | W | S | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | I | M | Y | E | C | L | I | G | W | P | P | F | C | S | E | T | P | Q | E | T | Y | R | K | I | M | N | F | E | Q | T | L | Q | F | P | D | D | I | H | I | S | Y | E | A | E | D | L | I | R | R | L | L | T | H | A | D | Q | R | L | G | R | H | G | G | A | D | E | I | K | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | H | P | F | F | R | G | V | D | W | N | T | I | R | Q | V | E | A | P | Y | I | P | K | L | S | S | I | T | D | T | R | F | F | P | T | D | E | L | E | N | I | G | Y | E | Y | S | R | F | D | Y | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S |
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