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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4logB_ | PDB header: transcription | Chain: B: PDB Molecule: maltose abc transporter periplasmic protein and nr2e3 | PDBTitle: the crystal structure of the orphan nuclear receptor pnr ligand2 binding domain fused with mbp |
Added to library: Sat Oct 12 08:27:22 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | M | P | N | I | P | Q | M | S | A | F | W | Y | A | V | R | T | A | V | I | N | A | A | S | G | R | Q | T | V | D | E | A | L | K | D | A | Q | T | N | A | A | A | E | F | L | D | S | I | H | E | T | S | A | R | L | L | F | M | A | V | K | W | A | K | N | L | P | V | F | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | B | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | L | P | F | R | D | Q | V | I | L | L | E | E | A | W | S | E | L | F | L | L | G | A | I | Q | W | S | L | P | L | D | S | C | P | L | L | A | P | P | E | A | Q | G | R | L | T | L | A | S | M | E | T | R | V | L | Q | E | T | I | S | R | F | R | A | L | A | V | D | P | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | F | A | C | M | K | A | L | V | L | F | K | P | E | T | R | G | L | K | D | P | E | H | V | E | A | L | Q | D | Q | S | Q | V | M | L | S | Q | H | S | K | A | H | H | P | S | Q | P | V | R | F | G | K | L | L | L | L | L | P | S | L | R | F | I | T | A | E | R | I | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | G | G | G | G | G | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | F | F | R | K | T | I | G | N | T | P | M | E | K | L | L | S | D | M | F | K | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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