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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4lg8A_ | PDB header: dna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: pre-mrna-processing factor 19; | PDBTitle: crystal structure of prpf19 wd40 repeats |
Added to library: Sat Aug 10 09:13:20 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | E | E | L | V | K | P | E | E | L | S | K | Y | R | Q | V | A | S | H | V | G | L | H | S | A | S | I | P | G | I | L | A | L | D | L | C | P | S | D | T | N | K | I | L | T | G | G | A | D | K | N | V | V | V | F | D | K | S | S | E | Q | I | L | A | T | L | K | G | H | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | K | V | T | S | V | V | F | H | P | S | Q | D | L | V | F | S | A | S | P | D | A | T | I | R | I | W | S | V | P | N | A | S | C | V | Q | V | V | R | A | H | E | S | A | V | T | G | L | S | L | H | A | T | G | D | Y | L | L | S | S | S | D | D | Q | Y | W | A | F | S | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | Q | T | G | R | V | L | T | K | V | T | D | E | T | S | G | C | S | L | T | C | A | Q | F | H | P | D | G | L | I | F | G | T | G | T | M | D | S | Q | I | K | I | W | D | L | K | E | R | T | N | V | A | N | F | P | G | H | S | G | P | I | T | S | I | A | F | S | E | N | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | Y | Y | L | A | T | A | A | D | D | S | S | V | K | L | W | D | L | R | K | L | K | N | F | K | T | L | Q | L | D | N | N | F | E | V | K | S | L | I | F | D | Q | S | G | T | Y | L | A | L | G | G | T | D | V | Q | I | Y | I | C | K | Q | W | T | E | I | L | H | F | T | E | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | ||||||||||||||||||
Sequence | S | G | L | T | T | G | V | A | F | G | H | H | A | K | F | I | A | S | T | G | M | D | R | S | L | K | F | Y | S | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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