|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4l9oA_ | PDB header: protein transport | Chain: A: PDB Molecule: protein transport protein sec13, copii coat assembly | PDBTitle: crystal structure of the sec13-sec16 blade-inserted complex from2 pichia pastoris |
Added to library: Sat Oct 5 09:33:43 2013 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | S | H | M | T | A | P | V | V | R | N | P | R | T | Q | F | P | I | F | H | W | C | R | G | G | K | A | L | S | M | L | P | K | F | D | T | Y | G | Q | S | K | V | E | I | N | I | V | G | S | G | S | V | T | I | G | N | A | H | D | D | L | I | H | D | A | V | L | D | Y | Y | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | R | L | A | T | C | S | S | D | K | T | I | K | I | F | E | I | Q | R | L | V | E | T | L | I | G | H | E | G | P | V | W | Q | V | A | W | A | H | P | K | F | G | V | I | L | A | S | C | S | Y | D | G | K | V | L | I | W | K | E | D | N | G | V | W | N | K | V | A | E | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | G | G | G | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | V | H | Q | A | S | V | N | S | V | S | W | A | P | H | E | Y | G | P | V | L | L | C | A | S | S | D | G | K | I | S | I | V | E | F | K | D | G | G | A | L | E | P | I | V | I | Q | G | H | A | I | G | V | N | A | A | S | W | A | P | I | S | N | T | R | R | F | V | S | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S | T | T | S | B | T | T | B | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | C | D | N | L | V | K | I | W | R | Y | D | D | A | A | K | T | F | I | E | E | E | A | F | Q | G | H | S | D | W | V | R | D | V | A | W | S | P | S | R | L | S | K | S | Y | I | A | T | A | S | Q | D | R | T | V | L | I | W | T | K | D | G | K | S | N | K | W | E | K | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | |
Sequence | P | L | T | K | E | K | F | P | D | V | C | W | R | A | S | W | S | L | S | G | N | V | L | A | I | S | G | G | D | N | K | V | T | L | W | K | E | N | I | Q | G | K | W | E | S | A | G | E | V | D | ||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|