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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4jueB_ | PDB header: protein binding | Chain: B: PDB Molecule: ubiquitin conjugating enzyme ubc9; | PDBTitle: crystal structure of plasmodium falciparum ubiquitin conjugating2 enzyme ubc9 |
Added to library: Sat Aug 24 08:31:26 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | S | I | A | K | K | R | L | A | Q | E | R | A | E | W | R | K | D | H | P | A | G | F | S | A | K | Y | S | P | M | S | D | G | K | G | L | D | I | M | K | W | I | C | K | I | P | G | K | K | G | G | L | W | E | G | G | E | Y | P | L | T | M | E | F | T | E | D | Y | P | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | P | P | K | C | K | F | T | T | V | L | F | H | P | N | I | Y | P | S | G | T | V | C | L | S | I | L | N | E | D | E | D | W | K | P | S | I | T | I | K | Q | I | L | L | G | I | Q | D | L | L | D | N | P | N | P | N | S | P | A | Q | A | E | P | F | L | L | Y | Q | Q | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | B | T | T | S | B | B | G | G | G | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | D | S | Y | E | K | K | V | K | K | Q | A | I | E | F | R | P | K | D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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