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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ijpB_ | PDB header: transferase/transferase inhibitor | Chain: B: PDB Molecule: serine/threonine-protein kinase prp4 homolog; | PDBTitle: crystal structure of human prpf4b kinase domain in complex with 4-{5-2 [(2-chloro-pyridin-4-ylmethyl)-carbamoyl]-thiophen-2-yl}-3 benzo[b]thiophene-2-carboxylic acid amine |
Added to library: Sat Aug 31 09:46:12 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | W | T | D | A | E | G | Y | Y | R | V | N | I | G | E | V | L | D | K | R | Y | N | V | Y | G | Y | T | G | Q | G | V | F | S | N | V | V | R | A | R | D | N | A | R | A | N | Q | E | V | A | V | K | I | I | R | N | N | E | L | M | Q | K | T | G | L | K | E | L | E | F | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | L | N | D | A | D | P | D | D | K | F | H | C | L | R | L | F | R | H | F | Y | H | K | Q | H | L | C | L | V | F | E | P | L | S | M | N | L | R | E | V | L | K | K | Y | G | K | D | V | G | L | H | I | K | A | V | R | S | Y | S | Q | Q | L | F | L | A | L | K | L | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | C | N | I | L | H | A | D | I | K | P | D | N | I | L | V | N | E | S | K | T | I | L | K | L | C | D | F | G | S | A | S | H | V | A | D | N | D | I | T | P | L | V | S | R | F | Y | R | A | P | E | I | I | I | G | K | S | Y | D | Y | G | I | D | M | W | S | V | G | C | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | T | T | S | S | S | T | T | T | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | Y | E | L | Y | T | G | K | I | L | F | P | G | K | T | N | N | H | M | L | K | L | A | M | D | L | K | G | K | M | P | N | K | M | I | R | K | G | V | F | K | D | Q | H | F | D | Q | N | L | N | F | M | Y | I | E | V | D | R | E | K | V | T | V | M | S | T | I | N | P | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | ||||
Sequence | K | D | L | L | A | D | L | I | G | C | Q | R | L | P | E | D | Q | R | K | K | V | H | Q | L | K | D | L | L | D | Q | I | L | M | L | D | P | A | K | R | I | S | I | N | Q | A | L | Q | H | A | F | I | Q | E | |||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | S | T | S |
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