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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4hkjD_ | PDB header: immune system/viral protein | Chain: D: PDB Molecule: cpxv203 protein; | PDBTitle: structure of cowpox cpxv203 in complex with mhci (h-2kb) |
Added to library: Wed Jan 9 16:46:09 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | C | E | K | X | E | E | E | T | W | K | L | K | I | G | X | C | I | Q | A | K | D | F | Y | S | K | R | T | D | C | S | V | H | R | P | D | V | G | G | G | L | I | T | E | G | N | G | Y | R | V | V | V | H | D | Q | C | E | E | P | N | P | F | I | I | A | T | T | K | Q | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | F | G | V | T | H | S | Y | I | E | F | S | N | S | N | T | G | A | P | E | N | I | P | D | C | S | K | H | I | L | I | S | V | Y | C | D | Q | E | A | S | G | L | D | F | H | T | L | K | Y | V | E | S | N | Y | L | H | I | T | V | K | Y | D | T | S | C | I | N | H | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | S | G | G | G | G | S | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | |||
Sequence | V | N | Y | S | F | X | N | E | C | E | R | K | L | T | S | I | Y | E | T | D | T | L | T | C | G | A | K | D | I | Q | T | R | D | K | Y | L | K | T | C | T | N | T | K | F | D | R | ||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | T | B | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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