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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4gizC_ | PDB header: viral protein | Chain: C: PDB Molecule: protein e6; | PDBTitle: crystal structure of full-length human papillomavirus oncoprotein e62 in complex with lxxll peptide of ubiquitin ligase e6ap at 2.55 a3 resolution |
Added to library: Fri Feb 1 11:46:47 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | Q | D | P | Q | E | R | P | R | K | L | P | Q | L | C | T | E | L | Q | T | T | I | H | D | I | I | L | E | C | V | Y | C | K | Q | Q | L | L | R | R | E | V | Y | D | F | A | R | R | D | L | C | I | V | Y | R | D | G | N | P | Y | A | V | C | D | K | C | L | K | F | Y | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | B | T | T | T | T | B | B | T | T | T | B | T | T | B | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | I | S | E | Y | R | H | Y | S | Y | S | L | Y | G | T | T | L | E | Q | Q | Y | N | K | P | L | S | D | L | L | I | R | C | I | N | C | Q | K | P | L | S | P | E | E | K | Q | R | H | L | D | K | K | Q | R | F | H | N | I | R | G | R | W | T | G | R | C | M | S | C | S | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | G | G | G | S | T | T | T | B | T | T | T | T |   | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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