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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4gc8C_ | PDB header: motor protein | Chain: C: PDB Molecule: flagellar motor switch protein; | PDBTitle: crystal structure of flim middle domain from h. pylori |
Added to library: Sat May 11 08:23:31 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | S | K | E | Q | L | R | S | F | R | S | I | H | D | K | M | A | R | N | L | S | S | Q | V | S | S | I | M | R | S | I | V | E | I | Q | L | H | S | V | D | Q | M | T | Y | G | E | F | L | M | S | L | P | S | P | T | S | F | N | V | F | S | M | K | P | M | G | G | T | G | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | E | I | N | P | S | I | A | F | P | M | I | D | R | L | L | G | R | E | F | S | D | I | E | L | N | L | L | D | T | I | L | R | Q | V | M | Q | I | L | K | E | V | W | S | P | V | V | E | M | F | P | T | I | D | A | K | E | S | S | A | N | V | V | Q | I | V | A | Q | N | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | I | S | I | M | V | V | L | E | I | I | I | G | H | S | R | G | M | M | N | I | C | Y | P | V | I | S | I | E | S | I | L | S | K | M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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