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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4cz2D_ | PDB header: signaling protein | Chain: D: PDB Molecule: ankyrin repeat domain-containing protein 27; | PDBTitle: complex of human varp-ankrd1 with rab32-gppcp. selenomet derivative. |
Added to library: Sat Jun 7 08:57:43 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | V | T | P | F | S | R | D | D | R | G | H | T | P | L | H | V | A | A | V | C | G | Q | A | S | L | I | D | L | L | V | S | K | G | A | M | V | N | A | T | D | Y | H | G | A | T | P | L | H | L | A | C | Q | K | G | Y | Q | S | V | T | L | L | L | L | H | Y | K | A | S | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | V | Q | D | N | N | G | N | T | P | L | H | L | A | C | T | Y | G | H | E | D | C | V | K | A | L | V | Y | Y | D | V | E | S | C | R | L | D | I | G | N | E | K | G | D | T | P | L | H | I | A | A | R | W | G | Y | Q | G | V | I | E | T | L | L | Q | N | G | A | S | T | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | Q | N | R | L | K | E | T | P | L | K | C | A | L | N | S | K | I | L | S | V | M | E | A | Y | H | L | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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