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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4cbzB_ | PDB header: signaling protein | Chain: B: PDB Molecule: protein jagged-1; | PDBTitle: notch ligand, jagged-1, contains an n-terminal c2 domain |
Added to library: Sat Nov 30 09:01:44 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | G | Q | F | E | L | E | I | L | S | M | Q | N | V | N | G | E | L | Q | N | G | N | C | C | C | T | R | D | E | C | D | T | Y | F | K | V | C | L | K | E | Y | Q | S | R | V | T | A | G | G | P | C | S | F | G | S | G | S | T | P | V | I | G | G | N | T | F | N | L | K | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | S | B | S | S | S | S | S | S | S | T | T | B | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | R | G | N | D | R | N | R | I | V | L | P | F | S | F | A | W | P | R | S | Y | T | L | L | V | E | A | W | D | S | S | P | D | S | I | I | E | K | A | S | H | S | G | M | I | N | P | S | R | Q | W | Q | T | L | K | Q | N | T | G | V | A | H | F | E | Y | Q | I | R | V | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | C | D | D | Y | Y | Y | G | F | G | C | N | K | F | C | R | P | R | D | D | F | F | G | H | Y | A | C | D | Q | N | G | N | K | T | C | M | E | G | W | M | G | P | E | C | N | R | A | I | C | R | Q | G | C | S | P | K | H | G | S | C | K | L | P | G | D | C | R | C | Q | Y | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . |
Sequence | W | Q | G | L | Y | C | D | K | C | I | P | H | P | G | C | V | H | G | I | C | N | E | P | W | Q | C | L | C | E | T | N | W | G | G | Q | L | C | D | K | D | L | N | ||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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