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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3wsoA_ | PDB header: ligase | Chain: A: PDB Molecule: f-box only protein 44; | PDBTitle: crystal structure of the skp1-fbg3 complex |
Added to library: Sat Mar 28 08:17:05 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | V | G | N | I | N | E | L | P | E | N | I | L | L | E | L | F | T | H | V | P | A | R | Q | L | L | L | N | C | R | L | V | C | S | L | W | R | D | L | I | D | L | V | T | L | W | K | R | K | C | L | R | E | G | F | I | T | E | D | W | D | Q | P | V | A | D | W | K | I | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | T | S | T | G | G | G | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | F | L | R | S | L | H | R | N | L | L | H | N | P | C | A | E | E | G | F | E | F | W | S | L | D | V | N | G | G | D | E | W | K | V | E | D | L | S | R | D | Q | R | K | E | F | P | N | D | Q | V | K | K | Y | F | V | T | S | Y | Y | T | C | L | K | S | Q | V | V | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | A | E | G | Y | W | E | E | L | M | D | T | T | R | P | D | I | E | V | K | D | W | F | A | A | R | P | D | C | G | S | K | Y | Q | L | C | V | Q | L | L | S | S | A | H | A | P | L | G | T | F | Q | P | D | P | A | T | I | Q | Q | K | S | D | A | K | W | R | E | V | S | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | ||||||||||||||
Sequence | T | F | S | N | Y | P | P | G | V | R | Y | I | W | F | Q | H | G | G | V | D | T | H | Y | W | A | G | W | Y | G | P | R | V | T | N | S | S | I | T | I | R | P | P | ||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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