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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3wcyA_ | PDB header: cytokine receptor/cytokine | Chain: A: PDB Molecule: interferon alpha/beta receptor 1; | PDBTitle: murine ifnar1 in complex with interferon-beta |
Added to library: Sat Jul 27 08:44:11 2013 | |
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Sequence | I | D | V | Y | I | I | D | D | N | Y | T | L | S | L | L | D | T | N | V | Y | I | K | T | Q | F | R | V | R | S | W | N | E | V | D | P | F | I | P | F | Y | T | A | H | M | S | P | P | E | V | R | L | E | A | E | D | K | A | I | L | V | H | I | S | P | P | G | Q | D | G | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | B | B | B | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | M | W | A | L | E | K | P | S | F | S | Y | T | I | R | I | W | Q | K | S | S | S | D | K | K | T | I | N | S | T | Y | Y | V | E | K | I | P | E | L | L | P | E | T | T | Y | C | L | E | V | K | A | I | H | P | S | L | K | K | H | S | N | Y | S | T | V | Q | C | I | S | T | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | B | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | A | N | K | M | P | V | P | G | N | L | Q | V | D | A | Q | G | K | S | Y | V | L | K | W | D | Y | L | F | R | A | Q | W | L | P | G | Y | S | K | S | S | S | G | S | R | S | D | K | W | K | P | I | P | T | C | A | N | V | Q | T | T | H | C | V | F | S | Q | D | T | V | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | B | S | S | S | S | S | S | S | S | B | S | S | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | G | T | F | F | L | H | V | T | S | F | W | S | E | E | K | F | I | D | S | Q | K | H | I | L | P | P | P | P | V | I | T | V | T | A | M | S | D | T | L | L | V | Y | V | N | C | Q | D | S | T | C | D | G | L | N | Y | E | I | I | F | W | E | N | T | S | N | T | K | I | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||
Sequence | M | E | K | D | G | P | E | F | T | L | K | N | L | Q | P | L | T | V | Y | C | V | Q | A | R | V | L | S | E | K | L | C | E | K | T | R | P | G | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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