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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3wbdA_ | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: single chain fv fragment of mab735; | PDBTitle: crystal structure of anti-polysialic acid antibody single chain fv2 fragment (mab735) complexed with octasialic acid |
Added to library: Sat Oct 19 09:10:36 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | D | V | V | M | T | Q | T | P | L | S | L | P | V | S | L | G | D | Q | A | S | I | S | C | R | S | S | Q | S | L | V | H | S | N | G | N | T | Y | L | Y | W | Y | L | Q | K | P | G | Q | S | P | K | P | L | I | Y | R | V | S | N | R | F | S | G | V | P | D | R | F | S | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | B | T | T | S | B | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | G | S | G | T | D | F | T | L | K | I | S | R | V | E | A | E | D | L | G | V | Y | F | C | F | Q | G | T | H | V | P | Y | T | F | G | G | G | T | R | L | E | G | G | S | Q | I | Q | L | Q | Q | S | G | P | E | L | V | R | P | G | A | S | V | K | I | S | C | K | A | S | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | T | F | T | D | Y | Y | I | H | W | V | K | Q | R | P | G | E | G | L | E | W | I | G | W | I | Y | P | G | S | G | N | T | K | Y | N | E | K | F | K | G | K | A | T | L | T | V | D | T | S | S | S | T | A | Y | M | Q | L | S | S | L | T | S | E | D | S | A | V | Y | F | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | B | T | T | G | G | G | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | ||||||||||||||||||||||
Sequence | A | R | G | G | K | F | A | M | D | Y | W | G | Q | G | T | S | V | T | V | S | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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