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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c3vziA_ | PDB header: dna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: crispr-associated protein cas5, dvulg subtype; | PDBTitle: crystal structure of crispr-associated protein |
Added to library: Sat Mar 30 08:18:59 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | M | S | Y | G | V | R | L | H | V | W | G | E | R | A | L | F | T | R | P | E | M | K | V | E | R | V | S | Y | D | I | I | T | P | S | A | A | R | G | I | L | E | A | I | H | W | K | P | A | I | R | W | V | V | D | S | I | Q | V | L | K | P | I | C | F | E | S | I | R | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | B | S | S | S | S | B | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | S | A | A | S | I | S | K | A | I | K | A | G | R | T | D | E | L | V | K | Y | V | E | E | D | R | Q | Q | R | A | A | T | V | L | R | E | V | G | Y | I | I | A | A | H | F | E | M | T | D | K | A | G | P | D | D | N | V | G | K | H | L | D | I | F | N | R | R | A | R | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | Q | C | F | Q | A | P | C | L | G | T | R | E | F | P | A | S | F | A | L | L | G | D | D | D | A | S | D | P | A | L | S | G | E | R | D | L | G | W | M | L | H | D | I | D | F | A | D | G | M | T | P | R | F | F | R | A | R | M | V | D | G | L | V | A | V | P | P | P | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | B | S | S | S | T | T | S | B | S | T | T | T | S | T | T | T | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | G | G | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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