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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2ylhA_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: agglutinin-like protein; | PDBTitle: structure of n-terminal domain of candida albicans als9-22 g299w mutant |
Added to library: Wed Jan 9 19:19:15 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | T | I | T | G | V | F | N | S | F | D | S | L | T | W | T | R | S | V | E | Y | A | Y | K | G | P | E | T | P | T | W | N | A | V | L | G | W | S | L | N | S | T | T | A | D | P | G | D | T | F | T | L | I | L | P | C | V | F | K | F | I | T | T | Q | T | S | V | D | L | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | D | G | V | S | Y | A | T | C | D | F | N | A | G | E | E | F | T | T | F | S | S | L | S | C | T | V | N | S | V | S | V | S | Y | A | R | V | S | G | T | V | K | L | P | I | T | F | N | V | G | G | T | G | S | S | V | D | L | A | D | S | K | C | F | T | A | G | K | N | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | T | F | M | D | G | D | T | K | I | S | T | T | V | D | F | D | A | S | P | V | S | P | S | G | Y | I | T | S | S | R | I | I | P | S | L | N | K | L | S | S | L | F | V | V | P | Q | C | E | N | G | Y | T | S | G | I | M | G | F | V | A | S | N | G | A | T | I | D | C | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | N | V | N | I | G | I | S | K | G | L | N | D | W | N | F | P | V | S | S | E | S | F | S | Y | T | K | T | C | T | S | T | S | I | T | V | E | F | Q | N | V | P | A | G | Y | R | P | F | V | D | A | Y | I | S | A | E | N | I | D | K | Y | T | L | T | Y | A | N | E | Y | T | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | S | B | B | S | S | S | B | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | ||||||||||||||||||||
Sequence | E | N | G | N | T | V | V | D | P | F | T | L | T | W | W | W | Y | K | N | S | E | A | D | S | D | G | D | V | I | V | V | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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