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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2ncjA_ | UNK | PDB header: dna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: uncharacterized protein; |
Added to library: Sat Jul 9 08:32:25 2016 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | R | T | P | L | L | L | Q | S | L | K | T | R | V | A | A | L | H | T | L | I | G | P | L | A | S | Q | R | H | F | S | P | R | F | D | R | Q | L | F | A | C | R | G | A | R | L | G | D | Y | L | T | E | A | E | E | S | L | T | H | L | E | A | A | V | N | Q | G | D | A | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | V | A | W | L | A | E | R | L | A | A | Q | I | E | A | L | Q | R | E | A | A | T | A | T | L | R | R | H | E | N | A | H | L | P | G | G | R | L | H | A | R | L | A | E | Y | Q | E | Y | E | R | R | L | L | A | M | K | N | E | R | E | Q | R | Y | A | E | R | H | D | P | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | ||||||||||||||||||||||
Sequence | L | A | R | E | I | T | A | L | D | E | R | L | T | R | C | R | T | A | I | A | R | T | E | R | A | L | E | R | I | T | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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