|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c2mkjA_ | PDB header: translation regulator | Chain: A: PDB Molecule: cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 4; | PDBTitle: solution structure of tandem rrm domains of cytoplasmic2 polyadenylation element binding protein 4 (cpeb4) in free state |
Added to library: Sat Jul 26 08:47:22 2014 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | S | H | Q | N | G | E | R | V | E | R | Y | S | R | K | V | F | V | G | G | L | P | P | D | I | D | E | D | E | I | T | A | S | F | R | R | F | G | P | L | I | V | D | W | P | H | K | A | E | S | K | S | Y | F | P | P | K | G | Y | A | F | L | L | F | Q | D | E | S | S | V | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | L | I | D | A | C | I | E | E | D | G | K | L | Y | L | C | V | S | S | P | T | I | K | D | K | P | V | Q | I | R | P | W | N | L | S | D | S | D | F | V | M | D | G | S | Q | P | L | D | P | R | K | T | I | F | V | G | G | V | P | R | P | L | R | A | V | E | L | A | M | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . |
Sequence | M | D | R | L | Y | G | G | V | C | Y | A | G | I | D | T | D | P | E | L | K | Y | P | K | G | A | G | R | V | A | F | S | N | Q | Q | S | Y | I | A | A | I | S | A | R | F | V | Q | L | Q | H | G | E | I | D | K | R | V | E | V | K | P | Y | V | ||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|