|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c1qrjA_ | PDB header: viral protein | Chain: A: PDB Molecule: htlv-i capsid protein; | PDBTitle: solution structure of htlv-i capsid protein |
Added to library: Mon Feb 10 11:16:33 2014 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | H | H | H | H | H | S | S | G | H | I | E | G | R | H | M | Q | M | K | D | L | Q | A | I | K | Q | E | V | S | Q | A | A | P | G | S | P | Q | F | M | Q | T | I | R | L | A | V | Q | Q | F | D | P | T | A | K | D | L | Q | D | L | L | Q | Y | L | C | S | S | L | V | A | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | H | Q | Q | L | D | S | L | I | S | E | A | E | T | R | G | I | T | G | Y | N | P | L | A | G | P | L | R | V | Q | A | N | N | P | Q | Q | Q | G | L | R | R | E | Y | Q | Q | L | W | L | A | A | F | A | A | L | P | G | S | A | K | D | P | S | W | A | S | I | L | Q | G | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | T | S | S | T | T | S | S | S | G | G | G | B | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | E | P | Y | H | A | F | V | E | R | L | N | I | A | L | D | N | G | L | P | E | G | T | P | K | D | P | I | L | R | S | L | A | Y | S | N | A | N | K | E | C | Q | K | L | L | Q | A | R | G | H | T | N | S | P | L | G | D | M | L | R | A | C | Q | T | W | T | P | K | D | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | S | T | T | T | B | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | K | V | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|